? ? ? ? 日前,由北京博奧晶典生物技術有限公司(以下稱“博奧晶典”)主辦的“單細胞測序技術應用培訓班”在上海圓滿落幕。來自全國各地近百位老師參加了此次培訓,現(xiàn)場座無虛席。此次培訓課程根據(jù)老師們的實際需求進行了優(yōu)化,增加了植物單細胞消化經驗分享及數(shù)據(jù)分析思路、單細胞Loupe可視化軟件個性化操作及高級分析軟件的應用等內容,旨在傳遞單細胞測序最新最熱的研究內容。
培訓現(xiàn)場盛況
博奧晶典科研服務事業(yè)部產品講師
? ? ? ? 本次培訓,各位講師介紹了10x Genomics單細胞測序平臺及BD Rhapsody單細胞平臺的相關技術,包括10x Genomics單細胞轉錄組測序、10x Genomics單細胞免疫組庫測序、10x Genomics單細胞ATAC、細胞表面蛋白及空間轉錄組技術,以及BD單細胞WTA檢測、TTA檢測、混樣及細胞表面蛋白檢測技術。從平臺介紹及常用研究工具分享到高分及重點應用案例解析,讓大家對單細胞測序技術有一個更全面的了解,參加培訓的老師們都表現(xiàn)出濃厚的興趣。
培訓班亮點
? ? ? ? 本次培訓有幸邀請到了發(fā)表在Molecular Plant雜志上的國內首篇植物單細胞文章共同一作,中科院植物生理生態(tài)研究所張?zhí)炱娌┦亢托熘薷┦俊?/span>
張?zhí)炱娌┦?/span>
? ? ? ? 張?zhí)炱娌┦吭@中國科協(xié)青年人才托舉工程、中國博士后創(chuàng)新人才支持計劃、Sanofi-SIBS青年人才獎學金等資助。具有豐富的植物單細胞實驗和數(shù)據(jù)分析經驗。多篇研究論文以第一作者發(fā)表在Plant Cell和Molecular Plant學術期刊上。此次報告,張?zhí)炱娌┦酷槍λ鳛楣餐蛔靼l(fā)表的國內首篇植物單細胞文章做了詳細介紹,并對實驗的研究背景、設計思路、實驗方案的實施以及實驗開展期間發(fā)現(xiàn)的問題和解決方案做了細致分享,老師們紛紛表示受益匪淺。
徐洲更博士
? ? ? ? 徐洲更博士主要研究植物基因組和單細胞轉錄組。從3年前開始在簡書和微信公眾號上發(fā)表關于轉錄組數(shù)據(jù)分析的內容,目前文章總閱讀次數(shù)近百萬。出于個人對生物信息的熱愛,獨立在一個實驗室搭建了生物信息學分析平臺。此次報告,徐洲更博士針對他作為共同一作發(fā)表的國內首篇植物單細胞文章的數(shù)據(jù)分析及常用生物信息學軟件做了詳細介紹,解決了大家在單細胞數(shù)據(jù)分析過程中存在的許多困惑。徐洲更博士風趣幽默的表達方式也為培訓班增添了更多活力。
博奧晶典測序平臺技術總監(jiān)劉杰博士
? ? ? ? 博奧晶典測序平臺技術總監(jiān)劉杰博士為大家?guī)砹藛渭毎麘腋∫褐苽浜陀嫈?shù)經驗分享。包括不同組織單細胞懸浮液的制備以及如何保證更穩(wěn)定的細胞產出,并一一解答了各位老師在前處理過程中遇到的問題,讓老師們對樣品制備的重要性有了更清晰的認識。
博奧晶典生物信息工程師彭巖博士
? ? ? ? 博奧晶典生物信息工程師彭巖博士,為各位老師帶來了單細胞轉錄組測序數(shù)據(jù)分析思路及常用軟件的介紹和實操訓練。包括Loupe可視化軟件的個性化操作,單細胞高級數(shù)據(jù)分析軟件操作以及互作網絡圖的繪制等。幫助各位老師更好的進行后續(xù)數(shù)據(jù)挖掘,以期滿足不同研究方向的個性化科研需求。
博奧晶典希望通過這一天的培訓
對各位老師今后的科研學習有所幫助
同時博奧晶典誠邀更多的老師參與到培訓中來
在這里收獲滿滿、快樂滿滿
本次培訓班完美落幕
感謝老師們的參與和支持
培訓班合影
培訓班現(xiàn)場互動討論
? ? ? ? 本次培訓沒有報上名的老師不用桑心,如果想要學習單細胞測序數(shù)據(jù)下機后常用的分群軟件Cell ranger、多樣品比較分析軟件AGGR的操作流程以及操作中的注意事項;結果可視化軟件loupe可以實現(xiàn)的功能及操作流程;以及一些常用的數(shù)據(jù)挖掘R包和軟件,如:擬時間序列分析、細胞互作分析及不同樣品相同亞群間如何進行差異比較分析等。歡迎參加6月29日在北京舉辦的“第二屆單細胞測序技術高端研討會”。
延伸閱讀
? ? ? ? 博奧晶典作為國內第一批引進10x Genomics平臺的公司,率先在國內開展上萬級通量的單細胞轉錄組測序服務。目前已經完成了2000多個樣品、100多種不同樣品類型的服務,覆蓋的物種和樣品類型包括人和小鼠的肝臟、肺臟、皮膚、心臟、腦、腎臟、血液、卵巢、神經,以及雞、斑馬魚、豬、水稻、擬南芥、油菜、白菜、橄欖等,是目前國內大規(guī)模單細胞測序經驗豐富的公司。
? ? ? ??博奧晶典于2018年9月與BD(中國)成立單細胞研究聯(lián)合實驗室,致力于大規(guī)模單細胞測序產品的開發(fā)和打磨,目前可開展如下單細胞測序產品和服務。
